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大幅進化的なぞぷよ，遊戲的介面與魔導物語相似，有簡單的RPG式場景與故事，體力值以不同的表情代表、經驗球亮燈表示等級突破程度等，都是來自魔導物語的特色。
畫面表現與前作相比說相當突出，尤其各個ぷよ的造型由前作的簡化造型變成了與AC版遊戲相似的詳細構圖，也會有同色ぷよ相鄰時會連結在一起的細緻演出。
謎題的安排方式與前幾作有很大的差異，例如謎題剛開始時有些ぷよ是浮在半空中的。遊戲中遭遇的每個對手會提出10題關卡，而對手總共有20個，因此關卡數合計是200題，不過沒有提供自創關卡的功能。
除了以解謎為主的NAZO PUYO模式外，本作也提供了TOKO PUYO 模式，即系列作中的「とことんぷよぷよ」模式，是單純追求高分的單人標準玩法。
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